近日,中國海洋大學海洋生物遺傳學與育種教育部重點實驗室包振民教授團隊在國際權威雜志Nature子刊Nature Protocols上在線發表了最新研究成果:串聯測序等長RAD標簽應用于高效、低成本全基因組范圍遺傳和表觀遺傳變異篩查分析。
這是該團隊繼2012年在Nature Methods、2015年在Open Biology后,再次在國際高通量基因組分析技術領域發表高水平論文,這也是學校首次在此期刊上發表論文,凸顯了中國海洋大學在相關研究領域的國際地位及重要影響力。
“海洋生物遺傳學與育種”教育部重點實驗室包振民教授和王師教授為該研究成果的共同通訊作者,該研究獲得國家自然科學基金、國家863計劃、山東省杰出青年基金、海洋國家實驗室“鰲山人才”等項目資助。
包振民教授團隊長期致力于發展適用于非模式生物的高通量、低成本的基因組學新方法和新技術。全基因組SNP分型技術是解析全基因組范圍內遺傳變異與性狀關系的核心技術手段,已成為生命科學領域大規模應用基因組信息進行重要性狀遺傳解析的研發熱點。在該最新研究中,團隊在前期開發的2b-RAD簡化基因組分型技術和MethylRAD全基因組DNA甲基化檢測技術的基礎上,成功研發了串聯標簽測序技術。
這項技術在一個測序片段(reads)實現了對多達5個標簽同時分析,解決了2b-RAD技術無法應用于雙末端測序平臺的局限,使得簡并基因組分析成本大大降低(單標簽測序成本僅為技術改進前的十分之一)。同時,該技術也首次實現了全基因組SNP分型和DNA甲基化的同步聯合分析。研發的新技術為低成本、大規模開展非模式生物特別是海洋生物基因組學及分子育種學研究提供了關鍵技術手段,也可應用于農作物、畜牧和模式動物等,具有廣闊的應用前景。
標簽:串聯測序
相關資訊